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动植物基因组Denovo测序
     
基因组从头测序(De novo sequencing)不依赖参考基因组对某物种进行基因组测序及拼接组装,绘制该物种的全基因组序列图谱。采用全基因组de novo组装及信息分析可以更好地帮助了解个体遗传特征,全基因组序列图谱完成后,可以构建该物种的基因组数据库;为后续的基因挖掘、功能验证提供DNA序列信息。

根据基因组的复杂程度,基因组可分为简单基因组和复杂基因组。
     

基因组

简单基因组

复杂基因组

重复序列比例

50%

50%

杂合率

0.5%

0.5%


基础分析
      
基因组survey
基因组组装分析
重复序列注释
基因组结构注释
基因功能注释
非编码RNA注释
假基因预测
共线性分析
基因家族分析
快速进化分析.


定制化分析

1)样品需求量:小片段文库≥1 µg2 Kb~6 Kb大片段文库≥20 µg10 Kb大片段文库≥30 µg20 Kb40 Kb大片段文库≥60 µg;完成全基因组测序样品DNA量需求约为500 µg~1 mg

2)样品浓度:小片段文库≥30 ng/µl,大片段文库≥133ng/µl

3)样品质量:基因组完整。如需建立≥5 Kb的插入片段文库,要求普通琼脂糖电泳(推荐用0.6%凝胶,选用λ-HindIII digest或其它具有20Kb以上条带的ladder80-120V电泳40-60min)结果,基因组DNA主带应在λ-HindIII digest最大条带23Kb以上,若有脉冲场电泳结果,则DNA主带应在40 Kb以上