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宏基因组测序分析
宏基因组学(Metagenomics),又称元基因组学,是以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象,无需分离培养,直接提取环境样本DNA进行测序。二代高通量测序平台具有通量高、准确性高、速度快、信息全等特点,能够显著加快宏基因组学研究的进程,并且在鉴定低丰度的微生物群落及种类,挖掘更多基因资源方面具有非常大的优势,完全能够满足常规微生物群体的物种分类研究、群落结构、系统进化、功能注释,样品间的物种或基因差异以及物种间的代谢网络等分析。通过深度挖掘具有应用价值的基因资源,为研究和开发新的微生物活性物质提供有力支持。
分析内容 解决问题
测序数据质量评估 过滤掉低质量数据,保证数据质量
基因预测 基因预测及相关性分析
物种、功能注释 物种、基因功能注释及相关分析
CARD 耐药基因相关分析
CAG/MLG分析 疾病和菌株关联研究
CNV(copy number variation) 菌株拷贝数变异与疾病关联研究
噬菌体 噬菌体及前噬菌体预测及分析